Родилась 6 января 1938 года в селе Красивая Поляна, ныне Нуримановского района Республики Башкортостан, в крестьянской семье. Русская. Окончила школу-семилетку.
Трудовую деятельность начала в феврале 1955 года дояркой шестого отделения совхоза МВД Башкирской АССР (с 1960 года - совхоз «Уфимский») Уфимского района, где проработала более 30 лет.
Будучи добросовестной, трудолюбивой работницей, отдавая все свои силы любимому делу, Л. И. Ганцева ежегодно добивалась высоких производственных показателей. В 1959 года от каждой закрепленной коровы получила 5236 килограммов молока, а в 1961 года - 5865 килограммов. Средний удой на фуражную корову за годы семилетки (1959-1965 года) составил 4540 килограммов, валовое производство молока - 4997,4 килограмма, его жирность — 4,1 процента. Л. И. Ганцева ежегодно получала и сохраняла теленка от каждой коровы, не допуская падежа молодняка.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 22 марта 1966 года за достигнутые успехи в развитии животноводства, увеличении производства и заготовок мяса, молока и другой продукции Ганцевой Лидии Ивановне присвоено звание Героя Социалистического Труда с вручением ордена Ленина и золотой медали «Серп и Молот».
В 1988 году вышла на пенсию. Скончалась 7 июля 2000 года.