Указом Президента Российской Федерации от 18.05.2005 г. № 545 назначена в Новосибирской области судьей Кировского районного суда г. Новосибирска на 3-летний срок судебных полномочий.

Указом Президента Российской Федерации от 17.11.2008 г. № 1618 назначена в Новосибирской области судьей Кировского районного суда г. Новосибирска.

Указом Президента Российской Федерации от 28.10.2011 г. № 1436 назначена судьей Новосибирского областного суда.

Указом Президента Российской Федерации от 19.06.2019 г. № 286 назначить со 2 сентября 2019 г. судьёй Восьмого кассационного суда общей юрисдикции.

ВККС РФ: от 29 февраля 2024 г. - прекратить 18 апреля 2024 г. полномочия судьи Восьмого кассационного суда общей юрисдикции Папушиной Натальи Юрьевны на основании подпункта 1 пункта 1 статьи 14 Закона Российской Федерации «О статусе судей в Российской Федерации» в связи с уходом в отставку.